Java版和PE版是《Minecraft》游戏中两种主要版本，是由不同的开发团队独立开发的。它们存在许多差异，包括玩法、部分方块、控制方式、游戏特性等方面。

Java版是最早开发的版本，它是基于Java编写的。它可以在PC、Mac和Linux等多个平台上运行，最初是为个人电脑设计的。Java版游戏玩法丰富，有更多的方块和物品，同时也支持MOD和插件，可以让游戏变得更加丰富和个性化。Java版的游戏还支持多人联机游戏和自定义服务端搭建。

Java版游戏代码示例：public class HelloWorld {public static void main(String[] args) {System.out.println("Hello World!");}}

PE版是移动设备版本，《Minecraft》编程语言。它适用于iOS、Android和Windows Phone等移动平台。PE版游戏中的方块、物品和游戏机制与Java版不完全一致。由于移动设备的限制，PE版可能无法支持大型的多人游戏，而且不能安装自己的MOD和插件。

PE版游戏代码示例：function chat(){var message = document.getElementById("chatInput").value;sendMessage(message);}

总的来说，Java版和PE版都有各自的优点和特点。Java版的游戏玩法更加丰富，可以进行自定义和多人联机游戏，而PE版则更适合移动设备，更加灵活便捷。具体选择哪一个版本，可以根据自己的需求和设备来决定。